药物研发技术服务

分子动力学模拟

分子动力学(MD)是一种通过计算机模拟技术来研究分子在原子层面上运动规律的方法。它通过求解牛顿运动方程,模拟分子系统随时间演化的过程,使得研究人员能够观察到分子结构的动态变化,并能在微观尺度上理解生物分子的物理性质。随着计算精度和性能的逐步提升,分子动力学模拟在生物体系研究及药物研发中正得到越来越广泛的应用。具体而言,分子动力学模拟常应用于研究:
  • 蛋白质的结构动态与功能:通过模拟研究蛋白质在生物过程中的结构动态变化,对理解蛋白质的功能和相互作用机制至关重要。
  • 隐蔽或变构结合位点识别:通过动力学模拟揭示蛋白结构中的变构调节位点,或揭示静态结构中无法观察到的隐藏口袋,为难成药靶点的药物设计提供思路。
  • 蛋白-蛋白相互作用:分子动力学可用于研究蛋白质之间的相互作用,揭示蛋白复合物的形成机制及其稳定性。
  • 疾病相关分子变异的影响:分析特定的遗传变异如何影响蛋白质结构和功能,进而影响疾病的发展。这有助于研究个体化医疗和精准治疗策略。
  • 蛋白质配体相互作用与选择性:通过分子动力学研究不同配体与靶标蛋白的结合模式,优化药物的选择性和亲和力。
  • 药物作用机制探索:利用分子动力学模拟深入理解药物如何在分子层面上与其靶点相互作用,揭示药物的作用机制。这对于设计更有效的治疗方法和提高药物疗效至关重要。

  服务模式

  • 针对客户需求开展项目调研,制定研究方案
  • 对目标蛋白及配体进行建模,包括结构预测、缺失片段补全、结构准备、力场参数调优等
  • 在高性能计算集群开展高效动力学模拟
  • 结合客户需求进行模拟轨迹分析,提取生物学见解

  康迈优势

  • 深厚的专业背景:我们的技术团队拥有长期从事分子动力学模拟研究的经验,并在相关领域有众多学术发表,对该领域有深刻理解。
  • 定制化研究方案:理解每个项目的独特性,康迈能够根据客户的具体需求,进行深入调研,提供量身定制的研究i方案。
  • 先进的计算资源:拥有强大的计算资源支持,确保模拟的高效率和准确性,加速研发过程。

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